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domenica 14 aprile 2013

Trascrizione DNA


RNA

la sequenza lineare degli amminoacidi di una sequenza polipeptidica determina la struttura della proteina, e questa struttura ne determina la forma.
L'acido ribonucleico (RNA) è una sostanza simile al DNA, ha un ruolo importante nella traduzione dell'informazione genetica, infatti le cellule molto ricche di RNA sintetizzano grandi quantità di proteine, e nelle cellule eucariote l'RNA si trova nel citosol dove avviene la sintesi proteica.
Esperimenti sui virus diedero una conferma di ciò: quando una cellula viene infettata da un virus, dal DNA viene sintetizzato l'RNA.

Differenze tra RNA e DNA


ZuccheroBase pirimidinicaStruttura lineareRipiegamenti
DNAdesossiribosioTiminaDoppio filamentoDoppia elica
RNARibosioUracileUnico filamentoUnico filamento



L'RNA messaggero ( mRNA) copia le informazioni e le porta dal nucleo al luogo dove si sintetizzano le proteine, queste molecole sono assemblate da uno dei due filamenti di DNA, come il DNA ogni molecola di RNA ha un estremità 5' 3' , ha lo scopo di trascrivere il messaggio di un segmento di DNA. Particolari sequenze nucleotidiche dette promotori sono i luoghi dove si lega l'enzima RNA polimerasi, qui si apre il DNA in due filamenti. I promotori sono i segnali di partenza per la sintesi dell'RNA, mentre esistono le sequenze di arresto che bloccano la sintesi.
Quando l'RNA messaggero ha finito il suo compito, questo si scompone nei nucleotidi che lo formano.









Ci sono tre fase quindi:

  • inizio dove RNA polimerasi riconosce il promotore e si attacca ad esso, questa operazione è aiutata da un fattore sigma
  • poi c'è la fase di allungamento dove RNA polimerasi sintetizza il trascritto di mRNA e il fattore sigma si stacca
  • fase finale quella di terminazione dove RNA polimerasi incontra una sequenza di arresto e blocca la trascrizione.

Però come abbiamo detto nel post precedente ci sono alcune parti chiamate introni ( erano il 24 % ) che non vengono tradotte in proteine, mentre gli esoni ( il 2 %) vengono tradotti. Questi introni furono scoperti quando tentarono di ibridare mRNA e Dna, due filamenti singoli di acidi nucleici tendono ad appaiarsi per formarne uno doppio, se si scalda una doppia elica di DNA questi filamenti tendono a staccarsi, ossia si denatura, prendendo uno dei due filamenti e raffraddandolo in presenza di mRNA si può capire quanto questi acidi nucleici siano simili in base alla lunghezza dei tratti che si appaiano, e non c'era corrispondenza tra le molecole di RNA maturo, quello che giunge nel citosol era diverso da quello prima.

Ma allora come si fa a raggiungere lo stato maturo? Prima della maturazione all'mRNA viene aggiunto un cappuccio di un insolito nucleotide chiamato 7metilguanosina, questo serve per far uscire l'mRNA dal nucleo per attaccarlo al ribosoma eucariote, viene aggiunta una coda poli-A che da stabilità alla molecola. Dopo di che avviene lo splicing, ossia un meccanismo con cui avviene il taglio degli introni e l'unione degli esnoni, essi sono saldati assieme, questi intorni vengono eliminati da un grosso complesso molecolare chiamato spliceosoma, sono subunità ( insieme di polipeptidi). Spesso pre-mRNA identici vengono rielaborati in molteplici mRNA maturi ( splicing alternativo). Come per esempio nella maturazione di ghiandole che producono ormoni.


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